保健省（MOH）は9月30日、新型コロナウイルス「Covid-19」の新規感染者数は1万2,735人だったと発表した。累計感染者数は224万5,735人となった。
州・地域別の感染者数はサラワクが最も多く2,487人だった。それに▽セランゴール（1,940人）▽ジョホール（1,241人）▽クランタン（1,232人）▽ケダ（1,033人）▽サバ（993人）▽ペラ（913人）▽ペナン（763人）▽トレンガヌ（726人）▽パハン（697人）▽クアラルンプール（KL、258人）▽マラッカ（194人）▽ネグリ・センビラン（132人）▽ペルリス（97人）▽プトラジャヤ（28人）▽ラブアン（1人）ーーが続いた。
29日には、1万7,000人が回復し、累計治癒者は累計で203万7,099人となり、死者数は208人で、累計で2万6,143人となった。アクティブ感染者は、前日から4,774人減少し、16万9,718人となった。アクティブ染者数のうち、82.8％が自宅、11.2％が低リスク者用隔離・治療センター（PKRC）、5.4％が医療機関、0.5％が集中治療室（ICU）で療養中となっている。
また同日は新たに15カ所のクラスターを確認。職場で9カ所、コミュニティで6カ所でクラスターが発生した。州・地域別ではクランタンが6カ所で最も多かった。